Совет является постоянно действующим межведомственным органом, образованным из представителей федеральных органов исполнительной власти, федерального государственного бюджетного учреждения «Российская академия наук», ведущих учёных, занимающих лидирующие позиции в области математических наук, для рассмотрения вопросов отбора и координации деятельности центров в целях предоставления грантов в форме субсидий из федерального бюджета на оказание государственной поддержки создания и развития центров в рамках федерального проекта «Развитие научной и научно-технической кооперации» национального проекта «Наука». 

Совет осуществляет следующие функции:

— рассматривает вопросы отбора и координации деятельности центров;

— проводит совместно с Министерством науки и высшего образования открытый конкурсный отбор центров в целях предоставления грантов, в том числе:

• определяет критерии конкурсного отбора в целях рассмотрения проектов программ создания и развития центров;
  
• рассматривает документы, направляемые Министерством науки и высшего образования в соответствии с пунктом 16 Правил предоставления грантов в форме субсидий 
  
• из федерального бюджета на осуществление государственной поддержки создания и развития научных центров мирового уровня, включая международные математические центры, центры геномных исследований, а также научные центры мирового уровня, выполняющие исследования 
  
• и разработки по приоритетам научно-технологического развития;
  
• заслушивает инициаторов создания центров;
  
• определяет победителей конкурсного отбора и размеры грантов;
  
• утверждает программы центров, признанных победителями конкурсного отбора.