Федеральный центр нейрохирургии Министерства здравоохранения Российской Федерации в Тюмени рассчитан на 95 коек, включая четыре специализированных нейрохирургических отделения по 20 коек (отделение нейроонкологии, отделение вертебрологии, сосудистое отделение, отделение функциональной и реконструктивной нейрохирургии) и одно отделение нейрохирургии детского возраста на 15 коек.
На базе учреждения располагается пять операционных, оборудованных современной нейрохирургической аппаратурой, позволяющей проводить хирургические вмешательства на высоком уровне с минимальными разрезами. Применяемые технологии дают возможность сократить сроки пребывания большинства пациентов в стационаре до трёх-пяти дней после проведения операции.
Консультативно-поликлиническое отделение рассчитано на 80 посещений в смену.
Центр введён в эксплуатацию в декабре 2010 года и начал работу с февраля 2011 года. В 2012 году Центр вышел на плановые показатели – 3 тыс. операций в год. Всего с февраля 2011 года по настоящее время было принято 27,5 тыс. пациентов (в том числе 3,3 тыс. детей) и проведено 6,8 тыс. операций (в том числе детям – 1,2 тыс. операций).
Высокотехнологичная медицинская помощь в Центре, наряду с пациентами из Тюменской области, оказывается жителям из 60 регионов страны из всех федеральных округов. Доля пролеченных больных, проживающих на территории других субъектов РФ, составляет около 42%. Жители других государств получают медицинскую помощь на платной основе.
Средняя заработная плата за 11 месяцев 2013 года составила: у врачей и работников, имеющих высшее образование – 106 394 рублей; у среднего медицинского (фармацевтического) персонала – 39 344 рублей.