Комиссия является координационным органом, образованным в целях формирования перечня инвестиционных проектов, имеющих общегосударственное, региональное и межрегиональное значение, которым предоставляется государственная поддержка за счет бюджетных ассигнований Инвестиционного фонда Российской Федерации, определения приоритетных направлений предоставления бюджетных ассигнований Фонда для реализации проектов, имеющих региональное и межрегиональное значение, а также рассмотрения вопросов, связанных с утверждением перечней приоритетных инвестиционных проектов федеральных округов и реализацией указанных проектов.